Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms