Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms