Protein–RNA interactions for Protein: P16519

PCSK2, Neuroendocrine convertase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK2P16519 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCSK2P16519 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK2P16519 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK2P16519 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK2P16519 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK2P16519 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK2P16519 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms