Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms