Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms