Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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