Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms