Protein–RNA interactions for Protein: K7ERE1

TMEM256-PLSCR3, TMEM256-PLSCR3 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms