Protein–RNA interactions for Protein: H3BNH8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNH8 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H3BNH8 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H3BNH8 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H3BNH8 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H3BNH8 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H3BNH8 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H3BNH8 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H3BNH8 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H3BNH8 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H3BNH8 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H3BNH8 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H3BNH8 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H3BNH8 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H3BNH8 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H3BNH8 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BNH8 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BNH8 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BNH8 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BNH8 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BNH8 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BNH8 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BNH8 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BNH8 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BNH8 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BNH8 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BNH8 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BNH8 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BNH8 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BNH8 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BNH8 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BNH8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BNH8 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BNH8 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BNH8 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BNH8 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BNH8 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BNH8 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BNH8 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BNH8 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BNH8 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BNH8 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BNH8 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BNH8 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BNH8 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BNH8 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BNH8 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BNH8 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BNH8 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BNH8 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BNH8 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BNH8 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BNH8 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BNH8 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BNH8 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BNH8 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BNH8 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BNH8 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BNH8 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BNH8 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BNH8 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BNH8 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BNH8 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BNH8 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BNH8 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BNH8 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BNH8 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BNH8 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BNH8 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BNH8 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BNH8 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BNH8 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BNH8 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BNH8 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BNH8 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BNH8 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BNH8 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BNH8 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BNH8 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BNH8 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BNH8 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BNH8 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BNH8 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BNH8 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BNH8 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BNH8 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BNH8 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BNH8 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BNH8 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BNH8 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BNH8 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BNH8 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BNH8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BNH8 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BNH8 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BNH8 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BNH8 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BNH8 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BNH8 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BNH8 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BNH8 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms