Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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LINC00587B1AMM8 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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LINC00587B1AMM8 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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LINC00587B1AMM8 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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LINC00587B1AMM8 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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LINC00587B1AMM8 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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LINC00587B1AMM8 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00587B1AMM8 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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