Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms