Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
E2F8A0AVK6 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms