Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI2

RIMKLB, Beta-citrylglutamate synthase B, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLBQ9ULI2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMKLBQ9ULI2 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms