Protein–RNA interactions for Protein: Q9P298

HIGD1B, HIG1 domain family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1BQ9P298 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
HIGD1BQ9P298 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HIGD1BQ9P298 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HIGD1BQ9P298 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HIGD1BQ9P298 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HIGD1BQ9P298 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HIGD1BQ9P298 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HIGD1BQ9P298 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HIGD1BQ9P298 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HIGD1BQ9P298 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HIGD1BQ9P298 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HIGD1BQ9P298 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HIGD1BQ9P298 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HIGD1BQ9P298 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HIGD1BQ9P298 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
HIGD1BQ9P298 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
HIGD1BQ9P298 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
HIGD1BQ9P298 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HIGD1BQ9P298 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HIGD1BQ9P298 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HIGD1BQ9P298 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HIGD1BQ9P298 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HIGD1BQ9P298 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HIGD1BQ9P298 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HIGD1BQ9P298 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HIGD1BQ9P298 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HIGD1BQ9P298 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HIGD1BQ9P298 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HIGD1BQ9P298 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HIGD1BQ9P298 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HIGD1BQ9P298 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HIGD1BQ9P298 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HIGD1BQ9P298 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HIGD1BQ9P298 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms