Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZD2

GLTP, Glycolipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLTPQ9NZD2 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GLTPQ9NZD2 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms