Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms