Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE6

SPAG4, Sperm-associated antigen 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG4Q9NPE6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms