Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms