Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms