Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CHCHD7Q9BUK0 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms