Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC39A3Q9BRY0 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC39A3Q9BRY0 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC39A3Q9BRY0 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC39A3Q9BRY0 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC39A3Q9BRY0 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC39A3Q9BRY0 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC39A3Q9BRY0 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC39A3Q9BRY0 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC39A3Q9BRY0 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC39A3Q9BRY0 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC39A3Q9BRY0 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC39A3Q9BRY0 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC39A3Q9BRY0 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC39A3Q9BRY0 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC39A3Q9BRY0 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC39A3Q9BRY0 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC39A3Q9BRY0 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC39A3Q9BRY0 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC39A3Q9BRY0 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC39A3Q9BRY0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC39A3Q9BRY0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC39A3Q9BRY0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC39A3Q9BRY0 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC39A3Q9BRY0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC39A3Q9BRY0 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC39A3Q9BRY0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC39A3Q9BRY0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC39A3Q9BRY0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC39A3Q9BRY0 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC39A3Q9BRY0 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC39A3Q9BRY0 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC39A3Q9BRY0 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC39A3Q9BRY0 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC39A3Q9BRY0 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms