Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNGAP1Q96PV0 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNGAP1Q96PV0 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNGAP1Q96PV0 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNGAP1Q96PV0 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNGAP1Q96PV0 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNGAP1Q96PV0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNGAP1Q96PV0 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNGAP1Q96PV0 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNGAP1Q96PV0 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNGAP1Q96PV0 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNGAP1Q96PV0 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNGAP1Q96PV0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNGAP1Q96PV0 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNGAP1Q96PV0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNGAP1Q96PV0 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNGAP1Q96PV0 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNGAP1Q96PV0 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNGAP1Q96PV0 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGAP1Q96PV0 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGAP1Q96PV0 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGAP1Q96PV0 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGAP1Q96PV0 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGAP1Q96PV0 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGAP1Q96PV0 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGAP1Q96PV0 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGAP1Q96PV0 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGAP1Q96PV0 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGAP1Q96PV0 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGAP1Q96PV0 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms