Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms