Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms