Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms