Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms