Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI2

CNKSR2, Connector enhancer of kinase suppressor of ras 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR2Q8WXI2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 TMX3-202ENST00000443099 913 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 AP000688.3-201ENST00000445464 348 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 AC025171.2-201ENST00000451894 1218 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 AC090371.1-201ENST00000580071 558 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 SPRR3-202ENST00000331860 985 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 AC079336.6-201ENST00000624836 613 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 AC004870.2-201ENST00000445615 831 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 Z98949.1-208ENST00000597614 816 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNKSR2Q8WXI2 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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