Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms