Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMNTD2Q8IXW0 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms