Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXK0

PHC2, Polyhomeotic-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC2Q8IXK0 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHC2Q8IXK0 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms