Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO38Q6PIJ6 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO38Q6PIJ6 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO38Q6PIJ6 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO38Q6PIJ6 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO38Q6PIJ6 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO38Q6PIJ6 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO38Q6PIJ6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO38Q6PIJ6 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO38Q6PIJ6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO38Q6PIJ6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO38Q6PIJ6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO38Q6PIJ6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO38Q6PIJ6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO38Q6PIJ6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO38Q6PIJ6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO38Q6PIJ6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO38Q6PIJ6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO38Q6PIJ6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO38Q6PIJ6 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO38Q6PIJ6 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO38Q6PIJ6 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO38Q6PIJ6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms