Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms