Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF123Q5XPI4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms