Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NBPF1Q3BBV0 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms