Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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