Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF2Q15853 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF2Q15853 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF2Q15853 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF2Q15853 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF2Q15853 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF2Q15853 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF2Q15853 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF2Q15853 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF2Q15853 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF2Q15853 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF2Q15853 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF2Q15853 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF2Q15853 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
USF2Q15853 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF2Q15853 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF2Q15853 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF2Q15853 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF2Q15853 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF2Q15853 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF2Q15853 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF2Q15853 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF2Q15853 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF2Q15853 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF2Q15853 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF2Q15853 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
USF2Q15853 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF2Q15853 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF2Q15853 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF2Q15853 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF2Q15853 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF2Q15853 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF2Q15853 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF2Q15853 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF2Q15853 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF2Q15853 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
USF2Q15853 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF2Q15853 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF2Q15853 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF2Q15853 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF2Q15853 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF2Q15853 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF2Q15853 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF2Q15853 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF2Q15853 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF2Q15853 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF2Q15853 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF2Q15853 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF2Q15853 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF2Q15853 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF2Q15853 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF2Q15853 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF2Q15853 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF2Q15853 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
USF2Q15853 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
USF2Q15853 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF2Q15853 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF2Q15853 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
USF2Q15853 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF2Q15853 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF2Q15853 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF2Q15853 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF2Q15853 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF2Q15853 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF2Q15853 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF2Q15853 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF2Q15853 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
USF2Q15853 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF2Q15853 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
USF2Q15853 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF2Q15853 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF2Q15853 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF2Q15853 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF2Q15853 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF2Q15853 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF2Q15853 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF2Q15853 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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