Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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