Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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