Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
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KCNMA1Q12791 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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