Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms