Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACTBP60709 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACTBP60709 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACTBP60709 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACTBP60709 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ACTBP60709 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ACTBP60709 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ACTBP60709 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACTBP60709 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACTBP60709 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ACTBP60709 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACTBP60709 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACTBP60709 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACTBP60709 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACTBP60709 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACTBP60709 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACTBP60709 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACTBP60709 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACTBP60709 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACTBP60709 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACTBP60709 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACTBP60709 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACTBP60709 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACTBP60709 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ACTBP60709 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACTBP60709 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACTBP60709 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACTBP60709 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACTBP60709 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACTBP60709 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACTBP60709 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTBP60709 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTBP60709 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTBP60709 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTBP60709 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTBP60709 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTBP60709 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTBP60709 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTBP60709 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTBP60709 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTBP60709 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTBP60709 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTBP60709 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTBP60709 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTBP60709 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTBP60709 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTBP60709 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTBP60709 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTBP60709 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTBP60709 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTBP60709 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTBP60709 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTBP60709 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTBP60709 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTBP60709 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTBP60709 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTBP60709 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTBP60709 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTBP60709 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTBP60709 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTBP60709 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTBP60709 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTBP60709 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTBP60709 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTBP60709 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTBP60709 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTBP60709 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTBP60709 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTBP60709 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTBP60709 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTBP60709 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTBP60709 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTBP60709 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTBP60709 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTBP60709 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTBP60709 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTBP60709 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTBP60709 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTBP60709 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTBP60709 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTBP60709 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTBP60709 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTBP60709 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTBP60709 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTBP60709 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTBP60709 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTBP60709 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTBP60709 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTBP60709 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTBP60709 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTBP60709 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTBP60709 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTBP60709 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTBP60709 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTBP60709 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTBP60709 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTBP60709 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTBP60709 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTBP60709 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTBP60709 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms