Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MCCD1P59942 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms