Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX16P57768 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX16P57768 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX16P57768 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX16P57768 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX16P57768 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX16P57768 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX16P57768 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX16P57768 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX16P57768 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX16P57768 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX16P57768 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX16P57768 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX16P57768 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX16P57768 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX16P57768 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX16P57768 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX16P57768 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX16P57768 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX16P57768 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX16P57768 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX16P57768 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX16P57768 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX16P57768 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX16P57768 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX16P57768 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX16P57768 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX16P57768 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX16P57768 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX16P57768 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX16P57768 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX16P57768 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX16P57768 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX16P57768 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX16P57768 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX16P57768 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX16P57768 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX16P57768 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX16P57768 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX16P57768 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX16P57768 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX16P57768 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX16P57768 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX16P57768 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX16P57768 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX16P57768 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX16P57768 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX16P57768 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX16P57768 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX16P57768 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX16P57768 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX16P57768 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX16P57768 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX16P57768 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX16P57768 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX16P57768 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX16P57768 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX16P57768 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX16P57768 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX16P57768 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX16P57768 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX16P57768 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX16P57768 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX16P57768 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX16P57768 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX16P57768 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX16P57768 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX16P57768 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX16P57768 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX16P57768 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX16P57768 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX16P57768 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX16P57768 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX16P57768 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX16P57768 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX16P57768 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX16P57768 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX16P57768 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX16P57768 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX16P57768 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX16P57768 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX16P57768 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX16P57768 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX16P57768 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX16P57768 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX16P57768 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX16P57768 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX16P57768 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX16P57768 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX16P57768 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX16P57768 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX16P57768 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX16P57768 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX16P57768 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX16P57768 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX16P57768 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX16P57768 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX16P57768 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX16P57768 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX16P57768 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms