Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV1P50549 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV1P50549 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV1P50549 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV1P50549 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV1P50549 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETV1P50549 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETV1P50549 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETV1P50549 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETV1P50549 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETV1P50549 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETV1P50549 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ETV1P50549 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETV1P50549 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETV1P50549 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETV1P50549 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETV1P50549 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETV1P50549 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETV1P50549 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETV1P50549 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETV1P50549 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETV1P50549 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETV1P50549 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETV1P50549 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETV1P50549 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETV1P50549 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETV1P50549 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETV1P50549 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETV1P50549 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETV1P50549 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETV1P50549 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETV1P50549 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETV1P50549 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETV1P50549 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETV1P50549 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETV1P50549 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETV1P50549 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ETV1P50549 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETV1P50549 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETV1P50549 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETV1P50549 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETV1P50549 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETV1P50549 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETV1P50549 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETV1P50549 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETV1P50549 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETV1P50549 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETV1P50549 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETV1P50549 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETV1P50549 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETV1P50549 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETV1P50549 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETV1P50549 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETV1P50549 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETV1P50549 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETV1P50549 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETV1P50549 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETV1P50549 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ETV1P50549 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETV1P50549 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETV1P50549 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETV1P50549 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETV1P50549 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETV1P50549 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETV1P50549 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETV1P50549 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETV1P50549 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETV1P50549 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETV1P50549 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETV1P50549 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETV1P50549 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETV1P50549 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ETV1P50549 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ETV1P50549 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETV1P50549 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETV1P50549 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETV1P50549 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETV1P50549 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETV1P50549 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETV1P50549 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETV1P50549 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETV1P50549 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETV1P50549 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETV1P50549 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETV1P50549 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETV1P50549 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETV1P50549 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETV1P50549 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETV1P50549 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETV1P50549 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETV1P50549 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms