Protein–RNA interactions for Protein: P49005

POLD2, DNA polymerase delta subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD2P49005 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD2P49005 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD2P49005 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD2P49005 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD2P49005 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD2P49005 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD2P49005 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD2P49005 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD2P49005 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD2P49005 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD2P49005 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD2P49005 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD2P49005 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD2P49005 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD2P49005 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD2P49005 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD2P49005 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD2P49005 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD2P49005 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD2P49005 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD2P49005 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD2P49005 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD2P49005 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD2P49005 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD2P49005 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD2P49005 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD2P49005 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD2P49005 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD2P49005 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD2P49005 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD2P49005 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD2P49005 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD2P49005 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD2P49005 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD2P49005 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD2P49005 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD2P49005 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD2P49005 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD2P49005 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD2P49005 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD2P49005 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD2P49005 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD2P49005 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD2P49005 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD2P49005 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD2P49005 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD2P49005 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD2P49005 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD2P49005 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD2P49005 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD2P49005 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD2P49005 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD2P49005 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD2P49005 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD2P49005 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD2P49005 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD2P49005 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD2P49005 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD2P49005 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD2P49005 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD2P49005 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD2P49005 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD2P49005 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD2P49005 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD2P49005 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD2P49005 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD2P49005 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD2P49005 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD2P49005 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD2P49005 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD2P49005 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD2P49005 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD2P49005 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLD2P49005 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLD2P49005 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLD2P49005 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLD2P49005 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLD2P49005 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD2P49005 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD2P49005 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD2P49005 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD2P49005 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD2P49005 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD2P49005 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD2P49005 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD2P49005 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD2P49005 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD2P49005 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD2P49005 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD2P49005 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD2P49005 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD2P49005 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD2P49005 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD2P49005 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD2P49005 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD2P49005 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD2P49005 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD2P49005 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD2P49005 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD2P49005 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms