Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZEB1P37275 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZEB1P37275 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZEB1P37275 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZEB1P37275 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZEB1P37275 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZEB1P37275 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZEB1P37275 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ZEB1P37275 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZEB1P37275 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZEB1P37275 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZEB1P37275 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZEB1P37275 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZEB1P37275 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ZEB1P37275 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZEB1P37275 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ZEB1P37275 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZEB1P37275 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZEB1P37275 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZEB1P37275 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZEB1P37275 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZEB1P37275 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZEB1P37275 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZEB1P37275 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZEB1P37275 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZEB1P37275 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZEB1P37275 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZEB1P37275 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZEB1P37275 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZEB1P37275 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZEB1P37275 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms