Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms