Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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HOXD10P28358 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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HOXD10P28358 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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HOXD10P28358 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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HOXD10P28358 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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HOXD10P28358 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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HOXD10P28358 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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HOXD10P28358 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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HOXD10P28358 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
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HOXD10P28358 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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