Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMA3P25788 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms