Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD46P15529 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD46P15529 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD46P15529 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD46P15529 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD46P15529 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD46P15529 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD46P15529 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD46P15529 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD46P15529 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD46P15529 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD46P15529 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD46P15529 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD46P15529 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD46P15529 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD46P15529 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD46P15529 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD46P15529 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD46P15529 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD46P15529 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD46P15529 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD46P15529 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD46P15529 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD46P15529 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD46P15529 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD46P15529 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD46P15529 FAM9B-203ENST00000428477 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD46P15529 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD46P15529 AC073115.1-201ENST00000436056 532 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD46P15529 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD46P15529 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD46P15529 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD46P15529 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD46P15529 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD46P15529 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD46P15529 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD46P15529 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD46P15529 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD46P15529 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD46P15529 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD46P15529 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD46P15529 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD46P15529 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD46P15529 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD46P15529 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD46P15529 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD46P15529 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD46P15529 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD46P15529 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD46P15529 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD46P15529 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD46P15529 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD46P15529 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CD46P15529 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD46P15529 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD46P15529 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD46P15529 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD46P15529 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD46P15529 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CD46P15529 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD46P15529 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD46P15529 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD46P15529 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD46P15529 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD46P15529 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD46P15529 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CD46P15529 AP002336.2-201ENST00000528607 539 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD46P15529 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD46P15529 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD46P15529 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD46P15529 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CD46P15529 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD46P15529 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD46P15529 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD46P15529 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD46P15529 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD46P15529 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD46P15529 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD46P15529 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD46P15529 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD46P15529 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD46P15529 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD46P15529 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD46P15529 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD46P15529 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD46P15529 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD46P15529 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD46P15529 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD46P15529 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD46P15529 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD46P15529 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD46P15529 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD46P15529 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD46P15529 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD46P15529 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD46P15529 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD46P15529 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD46P15529 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD46P15529 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD46P15529 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms